Les bactéries enfermées dans le biofilm sont extrêmement résistantes aux traitements antibiotiques ; cette résistance peut s'expliquer par des hypothèses, qui ne se limitent pas nécessairement aux suivantes. Tout d'abord, la bactérie du biofilm sécrété par le SPE, agit comme une barrière physique/chimique, empêchant ainsi la pénétration d'anticorps ou de nombreux antibiotiques. Le SPE est chargé négativement et fonctionne comme une résine échangeuse d'ions capable de se lier à un grand nombre de molécules d'antibiotiques qui tentent d'atteindre les biofilms incorporés. Deuxièmement, les bactéries du biofilm incorporé ne sont généralement pas activement engagées dans la division cellulaire, sont de plus petite taille et moins perméables aux antibiotiques. Nous démontrons ici pour la première fois que les cultures de biofilm d'aMycobacterium sont capables de se développer à des concentrations de médicaments plus élevées (c'est-à-dire ont des CMI plus élevées) que les cultures en suspension. La CMI de la concentration de certains médicaments qui inhibent la croissance exponentielle du biofilm s'est avérée plus élevée que la CMI de la culture planctonique. La littérature sur le biofilm offre essentiellement trois explications possibles à la résistance aux médicaments associée au biofilm : (i) Croissance plus lente du biofilm, (ii) Diminution de la pénétration du médicament dans le biofilm en raison de l'architecture et/ou de l'e